Alors qu'il chasse dans une chaîne de montagnes réputée maléfique, la Crête, Eragon, un jeune paysan âgé de 15 ans, découvre au sein d'une clairière une pierre de taille moyenne de couleur bleue, de forme anormalement ovale et parcourue de veines d'un bleu profond et de blanc. Mais la pierre se révèle en vérité être l'œuf d'un Dragon duquel ne tarde pas à émerger une dragonne bleue. Eragon, modeste paysan, devient alors le premier représentant des légendaires Dragonniers depuis plus de cent ans.

Eragon, conscient du danger, et sachant que le terrible roi Galbatorix (dragonnier lui aussi) a par le passé impitoyablement tué tous les Dragonniers qui s'opposaient à lui, décide d'élever secrètement sa dragonne, qu'il nomme Saphira, après s'être laissé inspirer du nom d'une Dragonne évoqué par Brom le conteur.

Après le départ de son cousin Roran pour aller travailler afin de pouvoir fonder une famille, deux étrangers nommés Ra'zac (personnages alliés à l'Empire de Galbatorix) viennent à Carvahall chercher l'œuf perdu. Saphira enlève Eragon pour qu'il échappe à leur fureur dévastatrice, mais Eragon retrouve sa ferme brûlée et son oncle torturé à mort. Eragon jure alors de venger son décès.

Eragon est rejoint par Brom qui connaît l'existence de Saphira, et dit vouloir les accompagner pour des raisons personnelles. Brom offre à Eragon l'épée Zar'roc, ayant appartenu à un ancien dragonnier. Brom transmet en chemin son savoir de magicien et de bretteur à Eragon. Alors que les deux hommes ont perdu la trace des Ra'zacs, Brom propose à Eragon de rejoindre Teirm, une cité où vit un ami de Brom, Jeod, qui pourrait les aider à trouver les Ra'zacs.

Après avoir obtenu les renseignements attendus de cette visite, Eragon se rend en compagnie de Brom à Dras-Leona, la cachette supposée des Ra'zacs. Ces derniers leur tendent un piège avant même qu'ils aient retrouvé leur trace, et les deux héros se soustraient de justesse aux griffes de leurs assaillants en s'enfuyant de la ville après qu'Eragon ait réussi à prévenir Brom de l'embuscade. Toutefois, ils ne leur échappent hors des murailles de Dras-Leona. Faits prisonniers, ils sont drogués afin que le nouveau Dragonnier et son mentor ne puissent pas utiliser la magie. Alors que les Ra'zacs s'apprêtent à tuer Brom, un mystérieux inconnu leur vient en aide et parvient à faire fuir les Ra'zacs. Cependant, la blessure de Brom, bien que rapidement soignée par les soins magiques précoces d'Eragon, étant trop grave, il décède. Sur le point de mourir, Brom lui révèle qu'il est lui-même un Dragonnier et que sa dragonne s'appelait Saphira, tuée par Morzan. Eragon, profondément meurtri par la mort de Brom lui confectionne une sépulture en pierre au sommet d'une montagne, que Saphira transforme en diamant avant de continuer sa route avec Murtagh, l'étranger qui les a sauvés, emportant avec lui les derniers souvenirs du conteur, qui fut pour lui, outre un mentor, comme un père.

Les deux compagnons cheminent alors en direction de Gil'ead où se trouve quelqu'un qui pourrait les renseigner sur la manière de rejoindre les Vardens. Murtagh se révèle très fort au maniement de l'épée. Lui et Eragon se neutralisent parfaitement. Cela permet à Eragon de continuer son apprentissage jusqu'à Gil'ead. Des Urgals les y attaquent. Eragon est enlevé, mais Murtagh et Saphira s'enfuient. Il s'évade alors avec l'aide de Murtagh et en profite pour libérer une elfe emprisonnée. Ils fuient devant toutes les troupes de la ville. Ils décident de rejoindre les Vardens en traversant le désert du Hadarac.

Là, Murtagh est arrêté et emprisonné pour ses origines. Eragon prouve ses talents de magicien et de combattant. Il doit poursuivre son apprentissage chez les elfes. Comme la ville va être attaquée par une masse d'Urgals dirigés par un fidèle de Galbatorix, Durza, ils organisent la défense : le combat commence, et dure longtemps. L'inévitable duel s'engage entre Eragon et Durza. Alors qu'Eragon est en mauvaise posture, Saphira et l'Elfe Arya détruisent "Isidar Mithrim", L'Étoile de Saphir. Des milliers de morceaux de verre tombent vers Eragon et Durza, et cette diversion permet à Eragon de planter son épée dans le cœur de l'Ombre, seul point faible pour tuer une telle personne. Mais avant de mourir, il perce une ouverture dans le dos d'Eragon, de l'épaule droite à la hanche opposée. Une mystérieuse force lui vient en aide, pendant son sommeil, lui susurrant des paroles apaisantes. Cette même voix le convainc de laisser Arya l'emmener à Ellesméra, la cité des Elfes dans Du Weldenvarden. C'est ainsi que finit le premier tome de la tétralogie "l'Héritage". On peut s'attendre dans le second épisode à ce qu'Eragon poursuive son apprentissage difficile de Dragonnier chez les Elfes

Au début du tome 2, les Vardens viennent de remporter la victoire sur les Urgals au cœur de Farthen Dûr. Eragon souffre d'une blessure, infligée par Durza, qui l'empêche de fournir de trop gros efforts sans subir de grandes souffrances.
Le chef des Vardens, Ajihad, ainsi qu'un groupe de guerriers qui l'accompagne, traque les Urgals échappés. Lorsque Ajihad revient à Farthen Dûr, il est tué par un petit groupe d'Urgals, revenus par les tunnels, malgré l'intervention d'Eragon, Saphira, Arya, Orik et des guerriers, arrivés trop tard pour empêcher le drame. Pendant cette attaque, Murtagh et les Jumeaux sont capturés par ces Urgals, et sont donc présumés morts car Arya a retrouvé les vêtements de Murtagh en se lançant à la poursuite des Urgals. Nasuada (la fille d'Ajihad) devient le chef des Vardens, et Eragon lui fait allégeance.
Eragon doit ensuite partir chez les Elfes avec Arya. Juste avant son départ, il rejoint le Dûrgrimst Ingeitum, un des clans des nains (bien que ceux-ci lui causent des problèmes plus tard). Il part donc à Ellesméra, capitale des Elfes, où il suit l'enseignement d'un vieil elfe dragonnier mystérieux, Oromis, et de son dragon couleur or, Glaedr, rencontre la reine des Elfes, Islanzadí, visite Ellesméra avec Arya, et s'entretient avec le chat-garou Maud et avec la forgeronne Rhunön.

De son côté, Roran subit les attaques des Ra'zacs, revenus le chercher. Il parvient à organiser la défense du village, mais Sloan, le boucher, trahit le village, et les Ra'zacs enlèvent Katrina, la fille de Sloan et fiancée de Roran. Ce dernier convainc presque tout Carvahall de le suivre pour rejoindre les Vardens au Surda. Ceux qui sont restés sont indubitablement tués et ce qui restait du village est détruit. À Teirm, ils découvrent qu'Eragon est un Dragonnier grâce à Jeod, un ami de Brom que Roran et un petit groupe de villageois rencontrent, puis ils s'enfuient vers le Surda à bord d'un bateau volé appelé L'Aile du Dragon.

Pendant ce temps, les Vardens émigrent au Surda. Lors d'une envoûtante cérémonie des Elfes, Eragon est guéri de toute cicatrice, dont celle infligée par Durza, et acquiert les capacité des elfes ainsi que leur apparence, ce qui fait de lui un hybride, mi-homme, mi-elfe. Eragon avoue son amour à Arya qui le repousse et affirme devoir repartir chez les Vardens.
À la suite d'une vision concernant une bataille très proche, Eragon et Saphira repartent chez les Vardens en jurant à Oromis de revenir. Ils arrivent sur le lieu de la bataille, un endroit inhospitalier nommé les Plaines Brûlantes, un jour ou deux avant que le combat ne commence. Eragon prend le commandement du Du Vrangr Gata (les magiciens des Vardens) et Nasuada le désigne comme son successeur au cas où elle mourrait. Elle fait une alliance avec des Kulls, délivrés de l'influence de Durza lors de la bataille de Farthen Dûr et désireux de se venger de l'Empire, pour lequel ils ont combattu sans être récompensés. Dans la fureur des combats, Eragon aperçoit un bateau venant de la rivière Jiet, il vole vers ce bateau et découvre son cousin, Roran.

Celui-ci, en plus de Carvahall, a reçu l'hospitalité de Dame Alarice, gouverneur de la cité de Dauth, où le bateau a jeté l'ancre pour refaire des vivres. Elle leur a également confié qu'une importante guerre se préparait sur les Plaines Brûlantes. Ceux qui ne pouvaient pas combattre étaient restés à Dauth, tandis que la plupart des hommes et quelques épouses de ceux-ci rembarquaient sur L'Aile du Dragon, en direction des Plaines Brûlantes.

Au cours de la bataille, un dragonnier inconnu arrive sur un dragon rouge (celui de la page de couverture) et tue Hrothgar, roi des nains. Eragon le combat, d'abord en l'air puis à terre. Le jeune homme se rend compte qu'il le connaît et lui arrache son casque, et découvre Murtagh. Il avait été capturé par les jumeaux, finalement des traîtres et a dû se soumettre à Galbatorix. C'est aussi à ce moment qu'Eragon se rend compte qu'il a plus ou moins anticipé cette scène, lors d'une vision reçue lors de son voyage à Ellesméra. Le Dragonnier lui prend Zar'roc, en arguant que l'épée doit revenir à l'aîné. C'est à ce moment-là que l'on comprend le titre du tome. Eragon aussi comprend alors qu'il est le fils de Morzan, le traître des Dragonniers, et le dernier des Parjures.

Les Vardens ont gagné la bataille mais l'avenir s'annonce sombre car les forces de l'Empire restent importantes, et parce qu'Eragon devra affronter deux Dragonniers plus puissants que lui. À la fin du livre, Eragon promet à son cousin Roran, qu'il va l'aider à délivrer Katrina, la fiancée de Roran, capturée par les Ra'zacs, et qu'ensemble, ils vengeront leur père Garrow.

Malgré une victoire très difficile sur l'Empire dans les Plaines Brûlantes, les Vardens doivent poursuivre leur résistance contre le tyran Galbatorix et ses armées. Plus que jamais déterminé à délivrer Katrina, Roran, accompagné d'Eragon, encore sous le coup des terribles révélations de Murtagh, (au service de Galbatorix) se dirige vers Dras-Leona, au cœur même du repaire des Ra'zacs, en Helgrind. Avec certaines difficultés, Eragon et Roran réussissent à tuer tous les Ra'zacs et délivrent Katrina. Eragon découvre également Sloan, le boucher, dans une cellule adjacente à Katrina. Pour le punir d'avoir révélé à l'Empire tout ce qu'il savait d'Eragon et d'avoir tué un honnête villageois de Carvahall, il envoie le boucher au pays des elfes pour qu'il se repente de ses crimes. Aussi, il le défend de jamais avoir de contact avec sa fille, que Sloan aime plus que tout. Pendant ce temps, Saphira ramène Roran et Katrina, qui ne savent rien de la punition de Sloan (Eragon leur mentant en disant qu'il l'avait retrouvé mort), au camp des Vardens. Eragon est alors obligé de revenir à pied, ce qui lui prend quelques jours. Sur le chemin du retour, il croise un mystérieux ermite nommé Tenga et Arya qui partait à sa rencontre. Ils discuteront de leurs devenirs et Arya lui révèle l'existence de son premier amour, Faölin. S'en suivra une rencontre avec des esprits qui en remerciement de la délivrance de leurs compagnons prisonniers dans Durza, donneront naissance à des lys de métal précieux vivant. Une fois rentrés au camp, un détachement d'elfes arrive de la part de la reine des elfes pour protéger Eragon et Saphira. Peu après qu'Eragon fut revenu, Roran lui demande de le marier à Katrina celle-ci étant enceinte. Alors que les préparatifs de mariage sont en cours, l'Empire attaque avec à sa tête le nouveau Dragonnier. Les troupes de l'Empire ne ressentent plus la douleur car Galbatorix leur a jeté un sortilège ce qui cause beaucoup de perte aux Vardens. Grâce à l'aide des elfes, Eragon et Saphira réussissent à repousser Murtagh.

Eragon célèbre le mariage de Roran, et leur offre des bagues permettant de toujours savoir où est l'autre, et de les appeler lui ou Saphira s'ils sont en danger. Eragon doit ensuite partir seul pour la cité des nains afin de participer à l'élection du nouveau roi des nains qui doit si possible être favorable à la cause Varden. Saphira le rejoint après l'élection pour reconstituer Isidar Mitrim, la gemme brisée en mille morceaux vers la fin de la bataille de Farthen Dûr. Finalement et au prix d'une tentative d'assassinat sur le Dragonnier, Orik est élu 43e roi des nains, et Eragon et Saphira partent au Du Weldenvarden pour finaliser leur apprentissage et si possible pour qu'Eragon ait une autre épée de Dragonnier bien que le temps leur soit compté. Une fois arrivé, Oromis leur explique l'extraordinaire puissance de Galbatorix qui réside dans la possession de nombreux "cœurs des cœurs" de dragon (autrement appelé Eldunarí). Eragon apprend le déplacement instantané des objets. Oromis lui révèle également certaines choses concernant ses origines: il n'est pas en réalité le fils de Morzan comme le lui avait révélé à tort Murtagh, mais le fils de Brom. Après, suite à la prédiction de Solembum (le chat-garou), il trouve le métal spécial nécessaire à la construction de l'épée d'un Dragonnier: le vif-acier, caché dans la forêt (près de l'arbre Meona qui se met en colère). Il forge l'épée à l'aide de Rhunön (à travers lui par la pensée) et la nomme Brisingr mais lorsqu'il prononce son nom, la magie s'active sur l'épée et elle prend feu, sans bien sûr l'abîmer.

Juste avant qu'Eragon reparte chez les Vardens, Oromis donne un artefact magique très puissant à Eragon et Saphira, ce qui augmente leur puissance et leur permet d'avoir une connexion avec l'elfe où qu'ils soient. Il s'agit de l'Eldunarí de Glaedr. Oromis dit qu'il va également partir combattre aux côtés des elfes, parce que cela ne sert plus à rien d'attendre au Du Weldenvarden pour un nouvel élève dragonnier. Alors qu'Eragon revient chez les Vardens, le siège de Feinster a commencé et Eragon y prend part. Tout va bien jusqu'au moment où trois mages à la solde de Galbatorix veulent invoquer un Ombre. Eragon et Arya essayent de les en empêcher mais ils n'y arrivent pas. Cependant, ils tuent l'Ombre en combat. Eragon apprend la mort d'Oromis et celle, physique, de Glaedr (qui reste ensuite piégé dans son Eldunarí) grâce à l'artefact, tués à Gil'ead par Galbatorix à travers Murtagh. Les Vardens prennent Feinster et s'apprêtent à prendre Belatona puis Dras-Leona et enfin Urû'Baen, la capitale où Galbatorix est caché, tandis que les elfes avancent par le nord et ont pris Ceunon et Gil'ead et s'apprètent a marcher sur Bullridge avant de rejoindre les Vardens à Uru'baen pour la grande bataille entre Galbatorix et Eragon.

Au début du tome 4, les Vardens assiègent Belatona, aidés d'Eragon et Saphira. Lors de l'assaut, cette dernière est blessée par une Dauthdaert, une lance de mort forgée par les elfes à l'époque de la guerre contre les dragons. Suite à la chute d'un mur du donjon, Roran passe à deux doigts de la mort, mais Eragon, Arya et Lupusànghren le retrouvent. Ils partent ensuite en quête de Lord Bradburn, le gouverneur de la ville. Alors qu'ils le retrouvent et le font prisonnier, ils apprennent l'arrivée des chats-garous. Nasuada reçoit le roi des chats, Grimrr demi-patte qui lui offre l'aide de son peuple, sous réserve qu'un coussin destiné à un chat-garou soit placé à la droite du trône en cas de victoire à Urû'baen. La chef de Vardens accepte, en échange de quoi les chats-garous devront être examinés mentalement.

Après s'être restaurés, Eragon, Saphira et Arya tentent une fois de plus de sortir Glaedr du chagrin que lui cause la perte de son dragonnier, mais celui-ci refuse de communiquer. C'est alors qu'Albriech arrive en courant, réclamant l'aide d'Eragon pour l'accouchement de sa mère. Roran, qui terminait la lessive de Katrina, fût averti de même par Baldor. Tous se rendirent à la tente du forgeron, puis attendirent. Les femmes de Carvahall refusèrent l'aide d'Arya malgré ses compétences en la matière, et le bébé finit par naître, affligé d'un bec-de-lièvre. Les villageois supplièrent alors Eragon de faire quelque chose. Le garçon emmena alors le bébé dans sa tente, et passa le reste de la nuit à chanter des enchantements afin de réparer le visage de l'enfant, sous la surveillance de Gertrude.

Nasuada et Orrin discutaient dans le château de Belatona, puis sans autre préambule, Orrin déclara que le pacte avec les urgals devait être rompu. Après le refus catégorique de Nasuada, celui-ci propose alors de contourner Dras-Leona afin de marcher droit sur Urû-baen, ce qu'elle refuse également, jugeant cela trop dangereux.

Sur ces entrefaites, Eragon termina de soigner le bébé, s'attirant les louanges des villageois, des soldats, mais aussi des elfes. Alors qu'Eragon prenait du repos dans sa tente, Nasuada confia la mission de prendre la ville d'Aroughs à Roran. Emmenant quelques hommes de Carvahall ainsi que son ami Carn, le magicien, Roran quitte le camp varden en direction du sud. Pendant ce temps, alors qu'Eragon s'entraîne à l'épée avec les elfes, Glaedr sort de sa torpeur afin de lui donner un conseil, puis se renferme à nouveau en lui-même.

Après quelques escarmouches, Roran arrive à Aroughs. Lorsqu’il eut débattu avec les soldats déjà présents, il décida d'utiliser les canaux parcourant la ville afin de pénétrer dans celle-ci. Il fit construire à ses hommes des barges, les solidifiant grâce à des plaques d'ardoises trouvées dans une carrière non loin de la ville ainsi que des sacs de farine trouvés dans les moulins jouxtant les canaux. Au prix d'une tentative d'assassinat, Roran réussit à mettre sur pied l'attaque et à effrayer les soldats venus les chasser. Puis, mettant en œuvre son plan, il parvint à rentrer dans la ville avec ses hommes. Cependant, Carn fut tué en combattant le magicien ennemi, mais il réussit à tuer son ennemi juste avant de mourir. Roran se prit une flèche dans le dos alors qu'ils étaient à la recherche du gouverneur de la ville mais le capitaine Brigman reprit le contrôle des opérations, et la prise de la ville se déroula comme prévu.

Pendant ce temps, les Vardens étaient arrivés à Dras-Leona. Ils s'apprêtaient à attaquer la ville lorsque Thorn avait fait son apparition. Depuis, le siège se poursuivait sans attaque d'aucun camp, jusqu'à ce que Jeod annonce avoir trouvé un passage secret. Eragon, Arya, Angela et Wyrden décidèrent de s'y rendre afin d'ouvrir la porte de l’intérieur, mais Wyrden fut tué et les autres capturés par les prêtres de Helgrind. Cependant, Angela l'herboriste réussit à se délivrer et délivra Arya et Eragon à temps juste avant que les oeufs de Ra’zacs éclosent et dévorent le dragonnier et l'elfe. Ils suivirent alors les couloirs jusqu'à remonter à la surface et se retrouvèrent dans la cathédrale de Dras-Leona, où ils affrontèrent les prêtres et les disciples. Après avoir tué tous les autres, ils se mesurèrent au grand prêtre, qui réussit l'exploit de tenir mentalement en échec un dragonnier, une des plus puissantes des elfes, un chat garou et une sorcière, tout en étant dangereux pour tous, avant qu'Angela le tue avec un poignard enchanté.

Pendant ce temps, Saphira, chevauchée par Lupusànghren, occupait Murtagh et Thorn afin que ceux-ci ne remarquent pas qu'Eragon s'infiltrait derrière leurs lignes. Ils se dirigèrent alors vers la porte, puis ouvrirent afin de laisser entrer les Vardens. Malgré l'euphorie de la victoire, Eragon et les elfes pleuraient la perte de Wyrden. Le dragonnier passa un moment dans sa tente en compagnie d'Arya, à boire pour oublier. Puis, Thorn lança une attaque surprise avec des soldats immunisés contre la douleur, tandis que Murtagh enlevait Nasuada afin de l'emmener à Urû-baen.

Alors devenu chef des Vardens, Eragon décide d'entreprendre un voyage à Vroengard, sur les instances de Solembum. Accompagnés de Glaedr, Eragon et Saphira s'envolent vers l'ile ancestrale des dragonniers. Ils essuyèrent une formidable tempête, mais parvinrent finalement sur l'île, où ils pénétrèrent dans la crypte des âmes après avoir décliné leurs vrais noms. Ils découvrirent alors des centaines d'Eldunarì et d'oeufs de dragons, cachés ici au temps de la chute, afin de préserver la race des dragons. Forts de leur découverte, ils s'envolèrent vers Urû-baen accompagnés des Eldunarì, laissant les oeufs cachés.

Arrivés au camp varden, ils révélèrent l'existence des Eldunarì à quelques personnes triées sur le volet, puis décidèrent d'un plan d'attaque. Alors que des elfes ouvraient une brèche dans la muraille, Roran menait son bataillon de l’autre côté. D’autres elfes créèrent une réplique parfaite de Saphira afin d’attirer Murtagh de l’autre coté de la ville. La vraie Saphira, accompagnée d’Arya, Elva, et de douze autres elfes pénétra dans la ville puis se dirigea droit vers la citadelle. Après avoir déjoué tous les pièges de Galbatorix, ils se retrouvèrent devant le roi qui les attendaient. Celui-ci ordonna à Murtagh et Eragon de se battre tandis que les Eldunarì du roi tenaient en échec ceux d’Eragon. Puis, Eragon planta son épée dans le ventre de son demi-frère avant de se retourner vers le roi pour le provoquer en duel. Murtagh lui fit alors comprendre qu’il avait changé de camp, puis désactiva les protections magiques du roi. Celui-ci prit alors le contrôle de l’esprit d’Eragon, tentant de le faire se soumettre. Le jeune dragonnier lança alors un sort qui arrêta le roi, puis lui planta également son épée dans le ventre.

Pendant ce temps, les Vardens étaient décimés un à un par le chef de l’armée, Lord Barst, aidé d’un Eldunarì. Il tua même la reine des elfes, Islanzadi. Roran finit pourtant par le tuer au prix de nombreuses blessures. Nasuada fut ensuite couronnée reine du royaume, où elle envoya Eragon vider les villes des dernières poches de résistance. Pendant ce temps, le dernier des dragons retenu par Galbatorix avait éclos pour Arya, qui l’élevait au Du Weldenvarden. Elle avait été dans le même temps couronnée reine des elfes pour remplacer sa mère.

La série l’Héritage se termine alors qu’Eragon quitte l’Alagaësia après qu’Arya lui ait avoué ses sentiments.